早在2013年，河源就出台最嚴格水環境保護考核制度《關於東江水環境綜合整治績效評價的意見》，當地政府每年與各縣區政府（管委會）簽訂環境保護責任狀，通過嚴格的考核問責及環保優先決策機制，確保實現水質保護目標。
為有效保護水環境質量，河源先後成立東江水環境保護工作領導小組和治污保潔工程工作領導小組，建立東江水環境保護、治污保潔工程兩個聯席會議制度，實行東江流域「段長制」、「河長制」。堅守嚴格的考核問責和環保「一票否決」制度，在所有重大事項決策時首先要過「環保關」。同時，每年度落實嚴格考核，必要時對相關縣區委書記、縣區長及分管領導等責任人進行通報批評、誡勉談話、停職檢查，甚至調整工作崗位。去年，河源出台方案進一步明確水庫水質保護總體目標和具體任務。
據統計，河源2013年以來在環保基礎設施建設和環境綜合治理方面投入資金逾17億元人民幣。目前，河源共建成投運生活污水處理廠27座，日處理能力達32萬噸，市區污水處理率超過93%；建成生活垃圾壓縮中轉站118個及13000多個自然村垃圾收集點，各縣生活垃圾衛生填埋場也建成投運。
