愛知·名古屋亞運會開幕前，住宿風波已引發爭議。韓國、印度、泰國等國代表隊公開吐槽，就連東道主日本代表團也未能幸免。

本屆賽事由於不設置傳統意義上的運動員村，參賽人員被分散安置在郵輪、集裝箱改建的宿舍和酒店。最早引爆爭議的是位於名古屋花園碼頭集裝箱改建的宿舍。9月11日，韓國男籃球員邊俊亨在社交媒體上傳影片，畫面中洗手盆下方不斷漏水，衞生間地面積水，並配文「請幫幫我們」。韓國籃協副會長鄭在勇隨後指出，35平方米的單元裏擺了四張床，單人床僅長1.95米，「身高超過兩米的運動員甚至無法伸直腿，這很不合理」。他直言這是「有史以來最差的一次」。韓國男籃已於16日集體搬至名古屋市內的酒店。

郵輪住宿最為混亂。多個代表團獲安排至停靠於名古屋港的郵輪「歌詩達賽琳娜號」（Costa Serena）住宿。印度綜合格鬥運動員桑亞爾16日抵達郵輪，登記時卻被告知找不到他的信息，等待約10小時後，他才入住一間雙人房。就在他入睡僅30分鐘後，另外兩名印度運動員也住進同一間房，雙人房變三人間。印度代表團團長亞達夫批評主辦方管理不善，並指「日本很好」的形象現在已經完全崩塌。泰國藤球隊所有人員也因主辦方未錄入運動員信息而無法辦理入住，滯留郵輪登船大堂等待長達24小時。其間，部分隊員因過於疲憊，直接躺地板休息。中國香港乒乓球運動員杜凱琹被安排入住郵輪房，她拍片分享登船過程，一看到房間也吐槽房間太小，雙人房行李箱攤開後連走路的地方都沒有。

日本代表團副團長水鳥壽思18日證實，郵輪住宿出現男女運動員被分配至同一房間、選手與教練同住等混亂情況。他指出，組委會僅按人數機械分配，完全忽略性別組合。不過，日本奧委會（JOC）已預估到住宿可能出現問題，提前在名古屋市內預訂了酒店客房作為後備。此舉引發輿論質疑，批評東道主「雙重標準」。